Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms