Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ribc2Q9D4Q1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ribc2Q9D4Q1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ribc2Q9D4Q1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ribc2Q9D4Q1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ribc2Q9D4Q1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ribc2Q9D4Q1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ribc2Q9D4Q1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ribc2Q9D4Q1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms