Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SdhdQ9CXV1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms