Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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