Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms