Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms