Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms