Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms