Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Snx8Q8CFD4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Snx8Q8CFD4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Snx8Q8CFD4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Snx8Q8CFD4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Snx8Q8CFD4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Snx8Q8CFD4 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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