Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Fbxo48Q8CAT8 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Fbxo48Q8CAT8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Fbxo48Q8CAT8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Fbxo48Q8CAT8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fbxo48Q8CAT8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fbxo48Q8CAT8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fbxo48Q8CAT8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fbxo48Q8CAT8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms