Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp20Q8C6M1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp20Q8C6M1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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