Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ctdsp2Q8BX07 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ctdsp2Q8BX07 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ctdsp2Q8BX07 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ctdsp2Q8BX07 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ctdsp2Q8BX07 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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