Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pggt1bQ8BUY9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms