Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Lrfn4Q80XU8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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