Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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