Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms