Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms