Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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