Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sycp1Q62209 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sycp1Q62209 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sycp1Q62209 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sycp1Q62209 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sycp1Q62209 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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