Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms