Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms