Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms