Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RubcnlQ3TD16 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms