Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms