Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms