Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms