Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psme1P97371 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme1P97371 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.3 ms