Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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Arf1P84078 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Arf1P84078 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Arf1P84078 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Arf1P84078 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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