Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms