Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
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