Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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