Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms