Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pou5f1P20263 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pou5f1P20263 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pou5f1P20263 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pou5f1P20263 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pou5f1P20263 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pou5f1P20263 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pou5f1P20263 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pou5f1P20263 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pou5f1P20263 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pou5f1P20263 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms