Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18524 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18524 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18524 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18524 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18524 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18524 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18524 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18524 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18524 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18524 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
P18524 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18524 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18524 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18524 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18524 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms