Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms