Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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