Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01680 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01680 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01680 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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