Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms