Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms