Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms