Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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