Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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