Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CadB2RQC6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CadB2RQC6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CadB2RQC6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CadB2RQC6 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CadB2RQC6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CadB2RQC6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CadB2RQC6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms