Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6880A3KG45 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms