Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Cldn13Q9Z0S4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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