Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms