Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Prg3Q9JL95 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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