Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms