Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms