Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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PtprtQ99M80 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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PtprtQ99M80 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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PtprtQ99M80 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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PtprtQ99M80 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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PtprtQ99M80 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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PtprtQ99M80 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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PtprtQ99M80 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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PtprtQ99M80 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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PtprtQ99M80 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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PtprtQ99M80 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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PtprtQ99M80 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms